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主题:Swanson从文献中发现隐藏联系的研究

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Swanson从文献中发现隐藏联系的研究  发帖心情 Post By:2006/6/5 20:30:08 [只看该作者]

    随着科学文献数量的增长和学科分类越来越细,大量的科学文献之间一定隐藏着未被发现的联系。这是人们都承认的事实,但是Swanson把这个事实证明了出来。DonR. Swanson目前是美国芝加哥大学的信息科学荣誉教授,他于1986年首次在医学文献研究中发现了这种关系的存在“雷诺氏病(A)是一种治疗方法和病因都未知的血液循环紊乱,有文献中记载了部分雷诺氏病患者血液中有某种异常,如血液黏度升高(B),同时,又在其他文献中发现食用鱼油(C)能纠正这种异常,例如它可以降低血液黏度。因此,Swanson把这两种知识联系起来得出食用鱼油(C)应该对雷诺氏病(A)患者有帮助的假设。在这个假说提出大约两年后,有人通过临床实验证实了这一点。1988年,Swanson用他的方法提出了周期性偏头痛与镁缺乏之间的联系,后来这种关系也被临床证实。此后,他又发现了很多具有隐藏联系的例子,他的研究成果引起了人们极大的兴趣。人们首次认识到从文献中可以发现知识。

    近年来,随着研究的深入,Swanson把自己的研究方向从发现无联系的事件(特定A与特定C之间),转到有微弱联系的事件。Swanson的合作者Smalheiser认为:我们或者知道A与C在实验上有联系,但是不知道它们是怎样联系的,或者我们想看一看关于A与C之间可能的关系,什么是已知的。比如一种饮食(A)与一种疾病(C)之间有着什么样的关系?A物质,或者A物质缺乏,会影响到疾病C发生的危险度吗?在探究A与C之间的潜在关系之前,应到首先进行传统的MEDLINE交集检索,以判定在医学文献中是否有该问题的直接答案。但是,如果A影响了某种因子(X),在直接用A和C检索的文献中没有被提及,而这个因子X又影响了C,那么在传统的检索中就不能发现A与C之间隐藏着的这种联系。如果检索者事先不知道X,即使A和C的文献中都分别提及了X,那么通过传统的数据库检索就不能判定是否有此类的存在。但是,这种联系在标题中或者在文摘的结论部分中会有所反映。例如,有两篇文章的标题分别是:
    (1)偏头痛与癫痫的关系
    (2)前瞻性报告:镁缺乏鼠作为癫痫病的动物模型
    偏头痛(A)与镁(C)之间的关系是通过癫痫(B)联系起来的。为此,他们合作开发了一个可以在网上运行的软件ARROWSMITH,通过这个软件可以将A和C两个主题的文献集合中共有的标题词列举出来,由此来反映两个表面上无联系的事件或者联系微弱的事件(偏头痛与镁)之间的潜在的联系(癫痫)。具体做法是:首先分别用A和C两个词进行MEDLINE的标题词检索,将检索到的文献标题分别存储。下一步则是到ARROWSMITH的网页上,把这两个文件的名字输入到相应的框中,同时上传这两个文件,随后该系统会产生一个列表(B2LIST),表中列出在这两个文件所存储的标题中同时出现的重要单词或者词组。这个表中的每一个词都有可能成为那个神秘的X。用户根据自己的经验把一些没有意义的、含糊的单词去掉。最后,ARROWSMITH把B2LIST中的单词都以链接的方式表现出来,点击任何一个X都会显示出相应的同时包含A和X的标题,下面一行会显示出同时含有X和C的标题。从这些标题中,用户结合自己的专业知识就可以从中发现主题之间的潜在的联系。

    Swanson认为ARROWSMITH的目标是帮助生物医学者发现新的、有用的联系,可以把它当作一种扩展MEDLINE搜索能力的软件,但不能替代传统的文献检索,因为它还必须在传统的文献检索的基础上开展工作。但是,这种方法本身也受到人们的怀疑。例如,HenrySmall就表示:他不在任何实验室工作,没有收集任何新的实验结果,而这些则是科学发现的首要途径。他认为,如果有关某个疾病的答案确是隐藏在文献中,当然就无庸置疑了。但是,如果偏头痛是由于我们目前干脆就未知的东西引起的,那么无论机器怎样努力工作,也找不到答案。但是对于解释和问题都已经存在的情况,Swanson的方法还是非常非常值得一试的。还有人认为,如果把这个工具交给掌握了医学知识的人的手中,就可能使这些人采用更加系统化的方式来梳理文献,会让他们注意到以前从未注意到的概念和文献,最终会使他们的工作更加有效、更具有创造性。
Swanson的研究成果几乎被人们当作一个传奇一直在医学图书情报界流传。正是由于Swanson的出色研究成果,2000年美国科学技术信息学会授予他该学会的最高荣誉奖。ARROWSMITH系统目前可以在网上免费使用,网址为:http://kiwi.uchicago.edu

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